В январе 2021 года Фонд поддержки научной и научно-технической деятельности молодежи «Время науки» открыл программу памяти Анатолия Шперха https://sperk.timeforscience.ru .
Средства, собранные в рамках программы памяти, направляются для поддержки семьи Анатолия Альбертовича, а также для создания «книги памяти». Фонд «Время науки» планирует издать сборник памятных материалов, содержащий как воспоминания коллег и учеников педагога и основателя «Школы инженерного мышления ЛНМО», так и методические материалы для педагогов для проведения «инженерных мастерилок» по методике Анатолия Альбертовича Шперха.